揭阳市疾病预防控制中心机构内设10个科（室、部），分别为办公室、科教信息及质量控制科、预防医学门诊部、流行病及寄生虫防治科、免疫规划管理科、公共卫生科、职业卫生科、检验科、城区疾病控制科、健康教育科。

（一）办公室综合协调中心日常工作，负责党务、组织人事、纪检监察、文秘、财务、后勤、档案、安全保卫、计划生育、工会、共青团和妇女等工作；负责常用仪器的维修、防治药物、器械、卫生材料等的采购、供应和保管等工作。

（二）科教信息及质量控制科负责宣传、科研、培训、学术交流工作；负责全市疾病控制系统的卫生信息网络的建设、管理，负责各项检测质量的管理和监督工作。

（三）预防医学门诊部负责从业人员和其他人员的健康体检，开展流行病、寄生虫病、慢性非传染疾病、职业病的咨询、诊断、治疗，负责预防注射服务和预防药物的供应。

（四）流行病及寄生虫防治科负责全市传染病（除免疫规划管理疾病外）控制监测规划、慢性非传染性疾病预防控制计划、艾滋病预防控制计划和寄生虫病控制、监测计划的组织实施；对重大疫情、传染病暴发充行组织调查和处理；开展急性传染病、慢性非传染性疾病的调查研究和监测工作；负责艾滋病疫情的调查处理；负责对全市HIV抗体检测实验室进行质控及评价；负责寄生虫病信息的收集、统计分析和综合评价，开展消杀灭服务工作；协助市爱卫办对全市城镇除“四害”工作进行考核鉴定；负责疫情资料的统计上报工作。

（五）免疫规划管理科实施计划免疫接种规划，负责脊髓灰质炎、麻疹、白喉、百日咳、破伤风、乙脑、风疹及新生儿乙肝等疾病的预防控制；负责免疫接种异常反应及事故的调查处理、有关生物制品质量效果评价和效果监测；开展疫苗可预防疾病的防治、监测；负责冷链管理工作。

（六）公共卫生科实施有关食品卫生、环境卫生、学校卫生相应的管理和监测工作；负责健康相关产品的检验受理及卫生学评价；参与对食物中毒、违法案件的现场卫生学调查；负责有关部门的专项抽检任务；实施碘缺乏病、地方性氟中毒的控制、监测计划；负责相关卫生监测资料的统计上报。

（七）职业卫生科负责职业卫生、放射卫生相应的监测工作，负责相关新产品、新材料的检验受理及卫生学评价，参与慢性职业中毒、放射性事故的现场卫生学调查，负责从事有职业危害人员的健康监护和管理；负责相关卫生监测资料的统计上报。

（八）检验科负责与健康相关产品、公共卫生、急慢性传染病、慢性非传染性疾病检验监测、病因研究和相关产品的微生物、理化、毒理学实验鉴定。

（九）城区疾病控制科负责榕城区、试验区、东山区、普侨区、大南山侨区疾病预防控制业务。

（十）健康教育科负责全市健康教育与促进的业务指导工作；开展对全市健康教育活动的检查和评估；开展全市各类健康教育与促进专业人员及有关卫生技术人员和重点人群的健康教育与健康促进的知识和技能培训；开展大众卫生科学知识宣传活动。